Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.6 ms