Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Cntn3Q07409 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Cntn3Q07409 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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