Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd13P70217 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms