Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Jade1-206ENSMUST00000191952 3327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm38059-201ENSMUST00000193746 1999 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gsdmc2-201ENSMUST00000089900 1981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Zmiz2-203ENSMUST00000109785 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Sulf2-207ENSMUST00000146497 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm40999-201ENSMUST00000222586 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm45827-201ENSMUST00000211955 311 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Mrgpra6-201ENSMUST00000073793 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 B230303A05Rik-201ENSMUST00000220672 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Plp1-202ENSMUST00000113085 2540 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Cdh16-213ENSMUST00000212882 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Pex12-201ENSMUST00000018877 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Rbm5-214ENSMUST00000182659 3205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Nkx1-1G3UXB3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Kdelc1-202ENSMUST00000065767 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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