Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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