Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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Col5a3Q9JLI2 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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