Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms