Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Pop5Q9DB28 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Pop5Q9DB28 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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