Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms