Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Nop56Q9D6Z1 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms