Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pagr1aQ99L02 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms