Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pacsin3Q99JB8 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms