Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ubxn4Q8VCH8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms