Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Actn1Q7TPR4 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms