Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CtifQ6PEE2 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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