Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atg9aQ68FE2 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms