Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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