Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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