Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trafd1Q3UDK1 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms