Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Samd11Q1RNF8 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Samd11Q1RNF8 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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