Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SbdsP70122 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms