Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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