Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Rpl28P41105 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms