Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms