Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms