Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ggta1P23336 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ggta1P23336 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ggta1P23336 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Ggta1P23336 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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Ggta1P23336 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Ggta1P23336 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ggta1P23336 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms