Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms