Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp9yF8VPU6 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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