Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spocd1B1ASB6 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spocd1B1ASB6 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spocd1B1ASB6 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Spocd1B1ASB6 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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