Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CtcflA2APF3 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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