Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3550W4VSN7 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms