Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms