Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Sncaip-202ENSMUST00000115410 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms