Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Pfdn1Q9CWM4 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Pfdn1Q9CWM4 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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