Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprtQ99M80 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprtQ99M80 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms