Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms