Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
NischQ80TM9 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms