Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Actn1Q7TPR4 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms