Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms