Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Sft2d1Q5SSN7 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms