Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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