Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Gm28047Q3US59 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm28047Q3US59 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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