Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc34Q3UI66 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ccdc34Q3UI66 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms