Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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