Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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Sh3bp1P55194 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Sh3bp1P55194 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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