Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PtprmP28828 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
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