Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Hoxd10P28359 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd10P28359 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd10P28359 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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