Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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