Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Pde6aP27664 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Pde6aP27664 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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