Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
H2-Eb1P04230 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms